99年度營利事業所得稅結算申報，如有研發支出適用投資抵減，應於6月30日前向中央目的事業主管機關提出申請

財政部臺灣省北區國稅局表示，公司申請適用產業創新條例第10條研究發展支出投資抵減者，應於辦理當年度結算申報期間開始前3個月起至申報期間截止日後1個月內，向中央目的事業主管機關申請認定當年度研究發展活動，始取得適用投資抵減租稅優惠之基本資格；而且於辦理當年度營利事業所得稅結算申報時，應依規定格式填報，並檢附有關文件送稅捐稽徵機關核定投資抵減稅額。
該局進一步說明，99年度研究發展活動是否符合高度創新之認定，各目的事業主管機關受理申請期限為100年2月1日至6月30日，公司所屬產業如係製造業及其相關技術服務業，相關申請表單及應檢附文件，可至經濟部工業局網站（http：//www.moeaidb.gov.tw）下載運用。
該局特別提醒，公司從事研究發展支出如要申請適用投資抵減，除了必須向中央目的事業主管機關申請認定當年度研發活動外，在辦理所得稅結算申報時，還要填寫申報書租稅減免部分第10-1頁「依產業創新條例申報減免稅額通報單」及第15-2頁「產業創新條例研究發展支出適用投資抵減明細表」，方符合適用租稅獎勵之程序要件。